Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CASC2Q6XLA1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms