Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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RTL8BQ17RB0 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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RTL8BQ17RB0 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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RTL8BQ17RB0 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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RTL8BQ17RB0 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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