Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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