Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms