Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HMGN3Q15651 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms