Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SS18Q15532 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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