Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHHQ15465 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms