Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRKQ15262 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PTPRKQ15262 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRKQ15262 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRKQ15262 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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