Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms