Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
UBXN2BQ14CS0 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms