Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
DSC3Q14574 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DSC3Q14574 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms