Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms