Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRPF4BQ13523 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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