Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ATMQ13315 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ATMQ13315 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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