Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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