Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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GRIN2AQ12879 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2AQ12879 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2AQ12879 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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