Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SMARCB1Q12824 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SMARCB1Q12824 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SMARCB1Q12824 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SMARCB1Q12824 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMARCB1Q12824 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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