Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CPSF1Q10570 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CPSF1Q10570 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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