Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LRRTM2O43300 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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