Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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LHX9Q9NQ69 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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LHX9Q9NQ69 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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LHX9Q9NQ69 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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LHX9Q9NQ69 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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