Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CDO1Q16878 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CDO1Q16878 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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