Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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