Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYPL1Q16563 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SYPL1Q16563 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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