Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPE65Q16518 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms