Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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