Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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