Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNN3Q15417 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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