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| FHL3 | Q13643 | AL109763.1-201 | ENST00000455391 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL583859.1-201 | ENST00000455871 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FHL3 | Q13643 | C18orf54-202 | ENST00000382911 | 4056 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | IL33-203 | ENST00000456383 | 2501 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC025423.5-201 | ENST00000550230 | 219 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AL359962.2-201 | ENST00000610044 | 303 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC004852.3-201 | ENST00000614131 | 326 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZYXP1-201 | ENST00000617638 | 118 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | HOTTIP_4.1-201 | ENST00000618195 | 165 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC010378.1-201 | ENST00000619270 | 362 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | Z69720.2-201 | ENST00000624755 | 279 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RXFP1-204 | ENST00000423548 | 3930 nt | TSL 2 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | TLR8-202 | ENST00000311912 | 3367 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | DOCK7-211 | ENST00000634264 | 6303 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF736P3Y-201 | ENST00000428264 | 1465 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC010733.2-201 | ENST00000589496 | 5702 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZMYND11-217 | ENST00000627286 | 3914 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | EVI2A-201 | ENST00000247270 | 1860 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF519P1-201 | ENST00000449011 | 1626 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | VPS13C-201 | ENST00000249837 | 13300 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | SCN1A-202 | ENST00000375405 | 8097 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP515-201 | ENST00000364570 | 118 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-384P-201 | ENST00000364900 | 104 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.339-201 | ENST00000365325 | 102 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1318P-201 | ENST00000365389 | 103 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1329P-201 | ENST00000365664 | 107 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORA75B-201 | ENST00000384053 | 137 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.579-201 | ENST00000390939 | 94 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR1179-201 | ENST00000408703 | 91 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR1183-201 | ENST00000408856 | 89 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |