Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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TCOF1Q13428 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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