Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SP140Q13342 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SP140Q13342 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms