Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ATMQ13315 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ATMQ13315 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ATMQ13315 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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