Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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TRAF3Q13114 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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