Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GPS1Q13098 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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