Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms