Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP2P78314 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP2P78314 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms