Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRDP23468 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRDP23468 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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