Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SPG7Q9UQ90 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SPG7Q9UQ90 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SPG7Q9UQ90 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SPG7Q9UQ90 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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