Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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USP18Q9UMW8 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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USP18Q9UMW8 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP18Q9UMW8 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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