Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1Q9UJ41 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1Q9UJ41 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1Q9UJ41 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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