Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATG3Q9NT62 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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ATG3Q9NT62 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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