Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
SMG1Q96Q15 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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