Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPNS2Q96L46 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms