Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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