Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms