Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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