Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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