Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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