Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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