Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms