Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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UBE3CQ15386 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
UBE3CQ15386 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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